许多研究报告了炎症性肠病(包括溃疡性结肠炎)患者与健康人相比肠道微生物组组成的变化。虽然这显然提出了关于肠道微生物在IBD发病机制中扮演的关键角色的问题，但我们还没有查明致病微生物及其机制。
过去几年的证据表明，肠道中的微生物产生的代谢物在保持肠系上发挥着至关重要的作用。
单独的遗传易感性不能完全解释当前的食物敏感性，如乳糜泻。科学家们表征了在遗传易受宿主中驾驶免疫激活和恶化的麸质中涉及的细菌酶弹性蛋白酶。
微生物群对免疫和代谢的影响已经有了很好的描述，但对微生物如何影响肠道屏障的整体结构和功能的基本认识还没有很好地理解。
Bouziat及其同事发表了一项新的学习，表明，reovirus是一种温和或临床沉默的病毒，这些病毒经常在一生中感染人类，可以破坏膳食蛋白的耐受性，并且可以构成用于CED发育的环境改性剂。
Heather Galipeau是麦克马斯特大学(加拿大)的助理研究员，她在那里研究饮食和微生物的相互作用在腹腔疾病和炎症性肠病。2015年，她在Elena Verdu的实验室获得了麦克马斯特大学博士学位
Gairdner基金会和加拿大麦克马斯特大学Farncombe研究所举行了一场题为“肠道微生物群:从协会到临床”的联合研讨会。
在《自然医学》(Nature Medicine)最近发表的一篇论文中，由INRA的Harry Sokol领导的一个小组研究了宿主基因如何影响肠道微生物群的组成和功能，进而影响代谢产物的产生和肠道炎症。
