细菌是一大批原核微生物(没有细胞核的细胞，与有细胞核的真核细胞相反，它们形成了人体)，是地球上出现的最早的生命形式之一。它们普遍存在于地球上的大多数栖息地，与植物、动物和人类生活在共生(互惠)、共生(吃同一种食物)或寄生(生活在或寄生在另一种生物体上并从中受益)的关系中。许多人认为所有的细菌都是病原体。虽然有些是有害的，但大多数是有益的，对保持健康是必要的。
细菌比人体细胞小10到50倍．据估计，人体中有40万亿微生物，包括至少1000种已知的不同种类的细菌，它们拥有300多万个基因——也就是说，比人类的基因多150倍。大的细菌群落生活在我们的皮肤和体腔中。我们的肠道中生活着最大的群体:肠道微生物群。
