2016年3月5日至6日，在美国迈阿密(Miami)举行的2016年世界肠道微生物峰会上，主要专家介绍了最新的肠道微生物群临床应用及其在人类健康和疾病中的作用。
研究人员知道婴儿粪便微生物群是一个信息宝库——它可以揭示分娩方式和饮食的细节——但基于微生物群的未来健康预测才刚刚开始出现
David Relman在最近一篇JAMA评论文章中说：“人类微生物群是人类意义的一个基本组成部分。”在这篇文章中，Relman描述了人类微生物群在健康中的重要性以及科学家如何测量它的简要历史。
这项中国研究旨在描述重度抑郁症（MDD）患者的肠道菌群特征：一组急性MDD患者（在抑郁量表上得分较高，表明有临床意义的抑郁），称为“活动性MDD”，另一组有MDD病史且对治疗有反应的患者（治疗4周后抑郁量表得分降低50%），称为“有反应的MDD”。
双歧杆菌是婴儿健康肠道菌群的关键标志。巴西的一项研究对49名新生儿(24个足月和25个早产(31.2周))进行了研究，使用qPCR方法探索了1个月新生儿粪便中双歧杆菌的患病率和浓度。
先前的研究表明，患有肠易激综合征(IBS)的成年人采用低FODMAP(可发酵寡糖、双糖、单糖和多元醇)饮食后，症状在2天内得到改善。低FODMAP饮食对儿童期肠易激综合征有同样的效果吗?肠道微生物群是否能预测对这种饮食干预有反应的儿童的饮食成功?
众所周知，prausnitzii粪杆菌通过阻断核因子（NF）-κB活化的分泌代谢物在体外和体内表现出抗炎作用。克罗恩病患者的微生物组中prausnitzii F.所占比例较低，这是与该疾病相关的微生物失调的特征。
特定的微生物群决定特定代谢物的水平吗?在婴儿微生物组建立过程中，代谢物谱是如何发展的?我们能根据肠道菌群和代谢物来评估一个人的生理状态吗?
炎症性肠病（IBD）涉及宿主和微生物群的各个方面。先前对成人的研究表明，IBD与微生物群差异有关，但对儿科患者的这种相关性知之甚少。
