虽然不是一个新的治疗近年来，粪便微生物区系移植(FMT)已被广泛应用于治疗复发性或难治性梭氧化钛艰难梭罗感染，显示一个整体治愈率为94％这几乎不会用标准抗生素治疗治愈的31％。

在患有粪便噬菌体的可能性也在克罗恩病那溃疡性结肠炎那肠易激综合症那肥胖那肝硬化甚至神经系统和行为条件。然而，需要大规模的研究来了解如何最好地利用这种治疗以及任何可能在其唤醒时出现的安全问题。

实际上，通过粪便移植恢复肠道微生物群并不总是没有不良反应。

一种新研究涉及广谱β -内酰胺酶(ESBL)产生的转移大肠杆菌从一个捐赠者到两个严重受损的老年患者．

第一位患者因丙型肝炎病毒感染继发肝硬化，接受15粒FMT胶囊5次超过3周治疗难治性肝性脑病。在接受最终FMT剂量后的17天，出现了发热和咳嗽等不良事件，同时血培养产生esbls呈阳性大肠杆菌．感染最终用抗生素解决。

新研究涉及扩展光谱β-内酰胺酶（ESBL）的转移 - 发布大肠杆菌从一个捐赠者到两个严重受损的老年患者

第二个患者患有治疗相关的髓细胞增强综合征，并于一项独立的临床试验中，他在同种异体造血细胞移植前第4天和第3天接受了15天和第3天进行了15个口服FMT胶囊。研究了FMT在肿瘤学中的使用是预防或治疗移植后并发症的手段，并用于提高新免疫治疗的疗效。患者在接受最终FMT剂量后10天从严重的败血症中死亡。对血液培养的分析显示出ESBL生产的存在大肠杆菌．

虽然来自患者的粪便样本对FMT之前的ESBL-产生的生物体产生阴性，但培养分析表明供体胶囊和血液分离物来自患者的ESBL制剂的共同抗菌抗性模式大肠杆菌．

同样的供体为另外20个体提供粪便样品，但没有开发的菌血症。即便如此，19个受试者中有9种的粪便样本含有在ESBL选择性培养基上增长的细菌。应该承认这项研究没有提及粪便移植是否为其他患者提供了任何益处。

这些发现导致美国食品和药物管理局(FDA)发布警报关于与使用FMT相关的严重或危及生命感染的潜在风险。最近，FDA警告说关于肠道致病菌引起的感染大肠杆菌和Shigatoxin-producing大肠杆菌在调查使用FMT之后发生了这一点。

数据突出了需要在施主筛选方案中包括筛选ESBL-生物的需要进行FMT。另一个纸张突出的突出表明还应该支付特别注意处理和存储用于FMT的粪便样本，标准化整个粪便移植生产过程。

这些发现导致了食品和药物管理局（FDA）发出关于与使用FMT相关的严重或危及生命的感染的潜在风险的警报

应该在高度受损的患者中避免那种活微生物也被一秒钟支持学习表明A.乳杆菌加护病房给予GG益生菌治疗导致6名年轻患者出现菌血症。

总而言之，尽管FMT的好处可能在治疗时超过风险C.艰难岩- 适当的腹泻，需要适当筛选供体样品，特别是在患者的上下文中，细菌易位的风险增加，例如研究中描述的那些。根据目前的数据，科学家认为，生产ESBL的生物应包括在2018年FMT的供体筛选方案中。

对于SARS-CoV-2也是如此:病毒RNA在患者体内长期存在。尽管FMT项目已经在许多地方暂停，但一旦COVID-19大流行结束，寻找这种病毒RNA并排除阳性患者作为捐赠者将是安全的，尽管缺乏关于通过粪便途径污染的风险的知识。

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