宿主和非团聚虫之间的互动相互作用在殖民化抗性（CR）中具有枢转作用，通过肠道病原体免受感染的保护沙门氏菌SPP。以前的研究支持这个想法包括对共生细菌的研究肠球菌粪便在哺乳动物的肠中发现，可以改善宿主肠道阻隔功能并限制感染引起的感染发病机制沙门氏菌肠癣伤寒术（S. Typhimurium.） 和Clostridium艰难术。然而，由于肠道微生物的复杂性，CR的潜在机制仍然很差。
最近学习， 由...领着Bärbel博士Stecher来自Max Von Pettenkofer卫生学院卫生和医学微生物学在Ludwig-Maximilians-大学慕尼黑大学（德国），发现了基于功能潜力设计细菌群落可能是改善动物模型健康的有效途径。研究人员开始了一系列小鼠细菌菌株，并使用基因组导向的方法产生了最小的细菌群落，一旦建立在无菌小鼠中，是成功的提供CR对抗人肠道病原体S. Typhimurium.。
首先，研究人员选择了12个细菌菌株的群落，称为寡核小鼠微生物群（oligo-mm12.），代表小鼠肠道的主要细菌植物的成员。虽然这种细菌联盟稳定地殖民化小鼠，并且跨越跨越术语垂直传输，移植寡核苷酸12.财团仅赋予了对口头的部分保护S. Typhimurium.感染;通过缺乏由Metagenome分析鉴定的若干功能能力，可以解释未能赋予抗性。
Oligo-mm的功能基因组分析12.研究人员通过将联盟进行了比较，并通过将其与传统微生物组的比较来确定其缺失的功能。研究人员创造了一种改进的寡头米的版本12.细菌群落，患有三种伴症厌氧菌（大肠杆菌MT1B1，链球菌Danieliae.ERD01G和葡萄球菌Xylosos33-ERD13C）来自小鼠肠道细菌收集（MIBC）;这个新版本确实提供了常规的Cr。兼性厌氧菌细菌，特别是大肠杆菌MT1B1，在促进CR反对中具有重要作用S. Typhimurium.通过包括氧气竞争的机制或厌氧电子受体如硝酸盐。
总之，这些研究人员开发了一种微生物群，可用于增强Cr;他们还证明了如何使用基因组导向的方法设计微生物群落，其可以作为探索肠道感染的背景下探索额外菌株的基础。
参考：
Brugiroux S，Beutler M，Pfann C等人。一种定义的小鼠微生物群的基因组导向设计，赋予沙门氏菌肠道塞洛维拉氏菌的殖民化抗性。Nat microbiol.。2016;2：16215。DOI：10.1038 / nmicrobiol.2016.215。
