肠道微生物群塑造宿主生理机能的一种方式是通过调节免疫反应．
虽然共生微生物对免疫系统的影响已经在疾病状态他们的影响健康个体的疫苗反应，它们对人类免疫力的因果贡献有限。
一个新的研究为首的巴厘岛Pulendran博士来自美国斯坦福大学的研究人员发现抗生素治疗引起的肠道微生物群中断可能对健康成人的流感疫苗免疫产生不利影响．
招募了22名健康成年人，在第0天接种流感疫苗。一半的参与者在接种季节性流感疫苗之前和之后都进行了抗生素预处理。
抗生素导致肠道微生物组成改变，其特征是16S核糖体核糖核酸拷贝数减少——在第7天到第30天之间恢复缓慢粪便中的鞭毛蛋白和脂多糖．然而，抗生素并不影响流感疫苗接种反应。
接种前和接种后血清中三价流感疫苗特异性抗体增加的个体比例在抗生素治疗组和对照组之间没有差异。
由于所分析的队列基线流感滴度高，作者希望探索抗生素对基线流感滴度低的受试者流感疫苗接种的影响。
在另外11名基线流感滴度较低的参与者中，抗生素导致肠道菌群组成和多样性的减少。此外,抗生素导致抗H1N1 a /California流感毒株免疫球蛋白G1 (IgG1)和IgA的下降，并改变了抗体对流感毒株的亲和力不同于基线流感滴度高的参与者的结果。
这些免疫细胞的变化还伴随着血清初级胆汁酸的增加和二级胆汁酸的减少，以及AP-1/NR4A炎症小体的激活，这与之前显示的模式相同在老鼠身上这是衰老的结果。
然而，抗生素没有改变其他免疫细胞亚群，如B细胞和T滤泡辅助细胞，或抗原特异性B细胞分化成浆细胞和活化的B细胞。
数据的系统分析(通过多尺度、多因子反应网络或MMRN)显示出肠道微生物组组成、相关代谢物水平、炎症途径和流感疫苗反应之间的进一步关系。在它们之中，肠道细菌和代谢物之间的联系主导了其他的联系。
例如，抗生素驱动的肠道微生物群改变通过不同的机制影响了h1n1特异性IgG1滴度和二级胆汁酸。
总之，这些发现通过分析抗原特异性抗体对免疫挑战反应的增加，显示了抗生素诱导的肠道微生物群改变对免疫的作用。在先前没有体液免疫的情况下(低基线浓度)在美国，抗生素治疗引起的肠道微生物群变化会损害抗体对流感疫苗的反应．
肠道微生物组通过多种机制影响体液对疫苗的反应，这项研究表明，在决定对流感疫苗的反应方面，共生微生物和相关血液代谢组变化之间的密切合作。
参考:
王志强，王志强，王志强，等。抗生素驱动的肠道微生物群扰乱改变了人类对疫苗的免疫力．细胞．2019;178(6): 1313 - 28。doi: 10.1016 / j.cell.2019.08.010。
