人体的大多数粘膜表面含有极其复杂的微生物生物体系。这些驻留的微生物在彼此的微妙平衡中存在于细腻的平衡和由每个宿主现场的特定局部环境因素决定的人体宿主。在健康中，伴随着宿主免疫系统的稳态存在许多不同的物种。微生物群的困难变化了社区，可能导致疾病。