人体的大部分粘膜表面都含有极其复杂的微生物生态系统。这些微生物彼此之间和人类宿主之间保持着一种微妙的平衡，这种平衡是由每个宿主身体部位的特定环境因素决定的。在健康状态下，组成微生物群的许多不同物种与宿主免疫系统保持着内稳态。微生物群的失调改变了群落，这可能导致疾病。