在过去的15年里，科学家们主要关注肠道微生物组的细菌部分，以确定其组成及其对人类健康和疾病的影响。尽管如此，真菌、噬菌体、古菌和原生生物也被认为是微生物群落的天然组成部分，现在，科学家们也开始对它们的生理相关性感兴趣。

最近的研究支持真菌微生物群（称为Mycobiota）在胃肠疾病发病机制中的作用，并表明了一种新的潜在治疗靶标。

最近审查讨论关于身体上真菌群落的组成及其在宿主健康和胃肠道疾病中的作用的已知信息。GMFH编辑与作者通信哈利科尔和Mathias L. Richard.通过电子邮件澄清肠道微生物菌群真菌成分的相关性，以及其研究在可预见的未来可能对临床实践产生的影响。

细菌代表含有较低的胃肠道的巨大微生物，而真菌代表着小部分。什么是Mycobiota的功能？

迄今为止，也没有理由说霉菌植物的重要性比细菌微生物群更重要，即使它在少数群体中存在。实际上，细胞计数水平不能被认为是比较这两个社区的唯一方法。例如，必须考虑细胞尺寸，并且真菌细胞的体积比许多细菌大100倍，因此表示具有有效的生产能力的更大的生物质。因此，像细菌一样，真菌可以（i）分泌一大组分子，即使低浓度，也可以影响宿主，和;（ii）将来自环境的分子代谢成活性分子。真菌还承受抗原（细胞壁β-葡聚糖或甘油，例如）与宿主免疫系统一起参与串扰，局部和远程。我们还显示出最近的一项研究，细菌和真菌社区可以互相影响，表明霉菌遗传症除了其对宿主的直接影响外，还可以通过对细菌微生物的影响间接地影响宿主。

在生物样本中表征真菌群落的方法是什么，以及与肌菌菌的主要挑战是什么？

该方法类似于用于细菌的方法。可以使用培养方法或元建测序靶向标记的方法，例如16s，但适应于真菌基因组，在大多数研究中，其1和2条条形码（用于内部转录的间隔物）局部化在真菌核糖核酸亚基之间。迄今为止，使用霰弹枪测序的Metagenomics方法并不完全准备用于真菌群落。首先，与真菌群落的多样性相比，数据库仍然差，小，这意味着它们需要相当多的改善。其次，真菌DNA的浓度远低于细菌，因此导致需要进行非常深的测序以检测显着信号。管理在细菌和宿主DNA中获得大部分小型真菌DNA分数“稀释”是未来的另一个重要挑战。

与胃肠细菌群落一样，真菌肌菌菌组成和功能可能受到宿主和环境因素的影响。哪些因素是菌根虫组成的最大决定因素？

在音乐会中至少有三个因素影响肌菌菌菌组成：（i）饮食，因为它含有真菌（奶酪，植物污染等），它还决定了肠道真菌的营养素的可用性;（ii）宿主在用粘液中的粘膜表面或用在肠腔内产生和分泌的不同分子（抗微生物肽，胆汁酸等），在许多方面，在许多方面明显与微生物液相互作用。（iii）重要的是，肠道微生物群的其他居民也是影响菌菌菌组成的因素。通过活性分子或间接通过宿主直接的细菌相互作用非常可能是真菌群落的主要决定因素。此外，其他真核生物或病毒可能是重要的，尽管他们已经受到迄今为止的研究。

在某些疾病中，真菌菌群可能是倾斜的，反过来，这可能是由肠道菌群多样性的疾病特异性改变和对真菌的黏膜免疫受损所驱动的。真菌菌群在哪些疾病中发挥了作用?肠道真菌失调的可能后果是什么?

历史上，真菌菌群参与了IBD发病机制，最显著的是与抗酿酒酵母抗体(ASCA)和克罗恩病相关。在体外和小鼠结肠炎模型中，一些真菌菌株也显示出促进或抗炎作用(白色念珠菌或布拉氏酵母分别)。然而，迄今为止，对IBD患者的管理没有临床意义。真菌菌群可能与代谢综合征和癌症等其他疾病有关，但我们仍处于相关阶段。

真菌微生物群在IBD发病机制中的参与是最广泛探索的领域之一。证据积累了IBD不仅受到共生细菌的影响，而且是共生真菌的影响。与健康受试者相比，我们如何了解有IBD患者的真菌微生物群脱泻病？

主要信息是，与IBD患者与健康受试者相比，霉菌在腔室或粘膜中强烈修饰。例如，在大量的235名患者中，我们表明IBD患者的粪便肌菌肌菌显示出Ascomycota的一滴水，这在底霉素升高的趋势平衡。虽然需要通过额外的研究来看待这一点，但是两个独立的研究似乎表明，糖酵母含有含量，念珠菌和Malassezia物种在IBD设置中占有困境。需要进行更多的深入研究，以便破译每种属在微生物群和炎症过程中的每个属的作用。

除了存在于下消化道的真菌菌群外，研究口腔、皮肤表面、阴道和肺等身体其他部位的真菌群落是否有关系?

它确实是!口腔由于其解剖位置，与胃肠道有联系，因此口腔定殖微生物会影响肠道定殖。因此，我们遵循肠道-口腔连接和口腔菌群组成是至关重要的。有研究表明，口腔菌群是人体中最多样化的菌群，所以它对肠道菌群的影响肯定是强大的。我们也知道，口腔真菌菌群已经是疾病的一个因素，特别是通过影响免疫缺陷或抗生素治疗的患者口腔念珠菌病。与肠道细菌相比，皮肤表面和阴道是真菌菌群存在比例相对较高的两个地方。例如，在皮肤中，真菌菌群可以达到总微生物群的10%。因此，真菌菌群对宿主的影响是非常重要的。此外，在这两个生态位中，真菌可以参与感染。更好地理解当地生态系统和微生物间相互作用的机制可能有助于开发新的治疗策略。

肠道肌菌遗址研究以及如何在不久的将来在临床环境中获益于针对特定的共谋真菌？

目前，我们的主要兴趣在于相当大的影响细菌和真菌可以在宏观环境中相互拥有。这两个王国在不同的地方居住了数千年，因此他们必须一起进化并保持强烈的互动。通过了解这些相互作用，我们确信我们可以针对特定的目标来限定特定目标，以影响微生物群和宿主在疑难生情况下。