肠道微生物社区的不平衡与炎症性肠疾病（IBD）和旨在阐明炎症疾病的贡献有关的研究主要集中于细菌．随后和正在进行的研究表征了真菌微生物群（称为王冠组织）IBD患者。然而，即使细菌和真菌微生物群可能在IBD患者中改变，甚至几乎不知道称为噬菌体（噬菌体）的原核病毒 - 微生物群的病毒组分，也称为人类肠道病毒-in肠道炎症。
一个新的学习为首的罗拉Hooper博士来自德克萨斯大学西南医学中心在达拉斯（德克萨斯州，美国），发现了小鼠结肠炎期间肠道噬菌体群落的组成发生变化．
研究人员首先使用了独立的方法验证从小鼠粪便中提取的重叠基因组序列数据具有病毒来源，并选择病毒序列进行进一步研究。然后，他们应用定量宏基因组学研究了t细胞介导的结肠炎小鼠模型中的肠道噬菌体。
定量宏基因组学显示，在结肠炎期间，肠道噬菌体的数量发生了改变随着结肠炎进展的随机分布，与对照小鼠相比，T细胞治疗后42天发生最明显的变化。
通过将基因组读数与驯化的病毒样颗粒数据库进行比较，观察到结肠炎期间的噬菌体群落改变。结肠炎与Caudovirales噬菌体的显着扩张有关，以及细菌社区的显着不平衡和增加变形菌门，它一致以前的数据．这些发现表明，在结肠炎期间肠道噬菌体的丰度被改变并与疾病状态相关。
结肠炎期间感染共生菌和病原体的噬菌体的丰度也不同．具体而言，最相关的变化是预测感染肠道疾病相关病原体的噬菌体。丰度的减少梭菌属的观察到噬菌体，而在结肠炎期间，噬菌体的噬菌体增加了预测的噬菌体链球菌sp。和alistipes.,连同梭菌属的预测会感染的噬菌体梭状芽孢杆菌．成员Spounaviridae已知的感染病原体的亚科，如金黄色葡萄球菌也增加了，作者认为它们可以用作疾病标志物。这些数据支持确定的噬菌体群体在结肠炎中的作用，以及它们作为小鼠结肠炎指标的潜在作用。
最后，结肠炎小鼠肠道中噬菌体群落的组成变化与在小鼠中观察到的相似炎症性肠病病人．链球菌sp。噬菌体的扩增和尾病毒目噬菌体的扩增透露在克罗恩病和溃疡性结肠炎患者的肠道微生物群中
这些发现显示了ibd微生物组图的复杂性，其中噬菌体群落现在已经成为一个新的角色。因此，病毒群的变化可能会导致小鼠的肠道炎症和细菌共生失调，突出表明病毒群是促进IBD中微生物群特异性改变的候选者。
参考：
Duerkop Ba，Kleiner M，Paez-Espino D等。鼠结肠炎揭示了疾病相关的噬菌体界．Nat Microbiol．2018;DOI：10.1038 / s41564-018-0210-y。
