基线微生物群可以解释为什么对靶肠微生物的外源干预措施的反应显示出高的内部间可变异性。在可以促进扰动细胞肠道微生物群组合物的因素中,抗生素的深刻效果已被广泛研究。然而,对抗生素的微生物组反应及其对宿主的持久效果仍然存在差。

一个新的小鼠的研究, 由...领着哈里博士斯科尔来自Sorbonne University和法国国家农业,食品和环境研究所(巴黎,法国),表明Amoxicillin-Clavulanate导致小鼠肠道微生物群组合物和结肠转录组的个性化变化

研究人员试图探讨人微生物对常规规定的抗生素阿莫西林 - 克拉氨酸的差异响应。为此,用两种无关的健康供体的肠道微生物植物化的无菌小鼠用Amoxicillin-Clavulanate治疗7天。

抗生素前后的肠道微生物组和结肠转录组分析揭示了根据供体基线肠道微生物群的不同反应,特别是在恢复期。虽然来自第一个供体的受体小鼠显示肠道微生物肿块Fvootella.粪便杆菌(与样品的聚类Fvootella.肠型),来自第二个捐赠者的受体小鼠展示了一种富含肠道微生物曲线伯曲面paraMacteroides.(与样品的聚类伯曲面enterotype)。

更有趣的是,两种供体组之间的抗生素治疗对抗生素治疗的反应显着不同。来自第一捐助者的受体小鼠显示出不稳定的肠道微生物群Clostridium.xivb,RoseburiaDorea.blautia.Fvootella.受到影响,而来自第二个供体的受体小鼠显示出更稳定的肠道微生物A型,只有只有属喇叭形球菌抗生素后18天显着增加。

因此,虽然从第一供体的肠道微生物肿块结构和小鼠中的小鼠中的特异性组织的变化中发现了一些关联,但是,与基线微生物生物的抗生素在第二组小鼠中的影响与基线没有不同。一起播放,这些调查结果表明在抗生素治疗后,第一个捐赠者的肠道微生物群中的速度较少,而抗生素治疗后的小鼠从第二供体接受肠道微生物的小鼠对抗生素给药更具弹性

在结肠转录组水平,抗生素治疗导致基因表达中的深刻改变- 抗生素给药和恢复后的早期期间 -无论基线肠道microbiota组成如何,这两个组都显示了重叠。具体地,观察到与生物粘附和感测有关的途径的增加,其中作者建议在通过抗生素通过肠道微生物扰动后的反弹反应。应该承认,尽管在两组中,尽管基因表达模式在两组中具有相似的抗生素,但是第一供体基团的肠道微生物蛋白扰动的大小较高。

众所周知,人体肠道微生物群结构在抗生素治疗后的恢复是个人之间的高度变化。然而,关于抗生素扰动引起的肠道微生物群变化的影响几乎没有研究。小鼠中的这些新发现揭示了肠道微生物肿瘤的个体间变异如何在抗生素引起的肠道微生物肿瘤干扰后有助于个性化反应。这些结果增加了肠道微生物组的越来越多的证据对环境因素的个性化反应

参考:

Lavelle A,Hoffmann Tw,Pham HP等人。基线微生物群组合物调节对肠道微生物群和宿主的抗生素介导的作用微生物组。2019年;7(1):111。DOI:10.1186 / S40168-019-0725-3。