最近审查，副教授苏珊娜Devkota在西奈医疗中心在洛杉矶（美国），揭示了在微生物组研究中控制外部因素的重要性，关注可能产生混淆效果的药物．
最近的研究强调了肠道微生物在药理学和精准医学中的作用。虽然肠道微生物群和几种人类疾病之间的关系众所周知，治疗的作用-包括药物和生活方式干预措施-可能会混淆报道的肠组合物仍然很大程度上是欠缺的．一种研究来自Forslund.等等。是第一个探讨二甲双胍治疗的分层，广泛规定的抗糖尿病药物是否影响了2型糖尿病（T2D）的微生物特征仍然是显而易见的。肠道微生物群部分介导二甲双胍的治疗和不良反应;实际上，未经治疗的T2D患者表现出有益丁酸的细菌的减少，其与二甲双胍治疗相反。研究人员得出结论，在T2D患者中，有必要将肠道微生物的疾病中的疾病中的疾病脱节。所以，药物-宿主-微生物的相互作用可导致药物治疗的疗效和副作用．由于药物治疗可能是潜在的混淆，“在寻找肠道微生物签名时，应分层患者的患者患有药物”那说Devkota博士。研究人员建议在进行前瞻性研究时，首先确定这些混杂因素并排除它们。但是，有一个局限性是很难找到足够多的患者没有接受治疗，并且为了研究药物-微生物相互作用而排除患者服药是不符合伦理的。
除了药物对微生物群落结构和功能的影响外，肠道微生物可以通过涉及药物或其代谢物的生物转化的途径影响药物治疗。因此，需要进一步研究药物 - 微生物组相互作用和基础机制。
总而言之，微生物组研究应该考虑药物治疗的影响，因为它们可能是一个潜在的混淆。由于处方药对人体肠道微生物群有影响，治疗的影响应免受效果的缺失对人类相关的微生物群的特异性疾病．
参考：
devkota s.微生物组。处方药模糊微生物组分析．科学．2016;351(6272): 452 - 3。
等。解开2型糖尿病和二甲双胍在人类肠道菌群中的治疗特征．自然．2015;528（7581）：262-6。
