2016消化疾病周是五月在圣地亚哥举行的，肠道微生物群在健康和疾病中的作用仍然是胃肠学中的主要话题．今年，微生物的功能作用，在临床和基础科学课程，那里是一个专注于微生物转移的研究在无菌小鼠，在代谢组学和环境基因组学是特别突出，并调节菌群来治疗疾病。
虽然微生物群涉及许多炎性疾病，例如IBD，乳糜泻和肥胖，但因果关系难以证明。DDW有许多会议突出显示使用无菌和无菌小鼠来阐明微生物在疾病发病机制中的功能作用的重要性．例如，Justin McCarville，博士候选人麦克马斯特大学展示，来自乳糜泻患者的微生物群可以诱导小鼠的先天免疫激活，独立于麸质暴露。这种机制可以在遗传易感宿主中促进乳糜泻。DDW的其他会议强调了使用这些“人性化”动物模型来评估机制以及特异性细菌代谢物的作用的重要性，例如来自SCFA和胆汁酸的那些，肥胖症，IBS和IBD。虽然受到小鼠建模实验的所有局限性，但八卵巢工具可能会带来关于微生物组研究中的功能的需要。
Metagenomics的使用是今年DDW的另一个讨论的主题。Rob Knight.他讨论了利用宏基因组学对炎症性肠病患者和健康对照组进行分类的方法，并强调纵向研究了解微生物群时间随着时间的重要性，以及基因组挖掘的重要性，以了解微生物和宿主如何合作产生代谢和免疫读数。
鉴于微生物群在疾病发病机制中的潜在作用，许多提出了治疗疾病的微生物调节策略。这些措施包括饮食干预、益生菌、抗生素和粪便菌群移植(FMT)。．FMT是今年DDW的热门话题;报告者涵盖了它对成人反复感染C. diff的有效性的数据。另一方面，关于FMT治疗IBD的数据是有希望的，但仍然是初步的。FMT的未来是一个主要的讨论话题;专家们一致认为研究人员需要揭示导致FMTs成功的捐赠者和患者的特征，并进行更长期的研究，以评估长期风险和副作用。
