虽然健康个体之间的肠道微生物群分布差异显著，但有几个特征被认为是“健康肠道微生物群”的定义。首先，在很多情况下，我们的肠道微生物群是可以被理解的冗余鉴于许多细菌种具有相似的功能。此外，健康的肠道微生物组是暂时稳定和抗扰动而且，随着时间的推移，它与自身的相似性比与另一个健康的人的相似性更大。最后，健康的肠道微生物群是有弹性的，这意味着在扰动后恢复到健康状态。例如，抗生素治疗后，我们的gut microbiota.通常在几周或几个月后恢复到以前的状态。因此，微生物健康的合理定义并不包括单一的静态，而是动态的平衡。与此同时，当干扰刺激变为慢性，并导致稳定的肠道微生物组改变，从而对宿主造成伤害时，这被称为生态失调。

在宿主体内平衡能力的背景下，欧洲食品安全局(EFSA)已经定义弹力为“系统在改变或失去正常功能之前所能吸收的扰动量，或系统恢复到稳定状态所需要的时间”。一个生物系统，包括人类的系统，在受到干扰时会进入一种短暂的状态，而恢复能力很可能有助于达到健康的稳定状态。

当我们把人类的健康和肠道菌群作为一个生态系统来考虑时复原力能够使一个人在暴露于包括外生物质在内的环境压力源时保持健康或更快地恢复压力和不平衡的饮食．一旦建立，在2至3岁的时候，人体肠道微生物群就发现了相对的稳定状态．事实上，据报道，虽然微生物组的组成在生命的最初几年发生了巨大的变化，但这是功能概要在肠道中，所谓的“核心”健康微生物群在早期就建立起来了，此后保持稳定。关于社区集会,目前的研究关于人类微生物在生命早期对健康的影响，将重点从“它们是如何形成的”转移到“谁以什么顺序形成的”。

虽然饮食变化和药物管理局可以将肠道微生物群移动到交替稳定状态，但我们的微生物群通常达到稳定状态，类似于与基础状态不同的稳定状态。扰动的幅度和恢复的速度和程度跨越各个而且甚至在个人内。定义基线健康的微生物体是一个目前的挑战考虑到在我们的生命周期中肠道微生物群的高度复杂性和可变性，识别反映偏离的特征也同样重要。

这机制赋予微生物群稳定状态弹性的因素包括物种丰富度、功能响应多样性、密集肠道环境中的竞争以及涉及肠道菌群及其宿主复杂关系的特定变化。

除了Gut Microbiota弹性之外，免疫系统还参与了对食品，环境组分和共生肠道微生物的无源反应，这些肠道微生物群在正常情况下没有威胁。例如，尽管炎症是对感染的正常宿主反应的一部分，但慢性炎症的过度活跃的免疫应答是有害的，可能导致慢性炎症性疾病如类风湿性关节炎和肥胖症。此外，营养，肠道微生物瘤和宿主免疫反应之间的间接沟通突出了肠道微生物酵母通过饮食调节免疫应答的微调作用。

考虑到这些数据，考虑到它的组成和功能多样性，肠道菌群定殖的能力要抗拒或从扰动中恢复恢复反映了一个人保持健康的能力．因此，弹性是如此新兴的健康生物标志物．

在一个评论那玛丽埃伦·桑德斯和同事认为肠道微生物A的稳定性作为稳态的生物标志物，说明改进的稳态导致干预后的特定措施的最小变化。实际上，这意味着假设测量参数的窄控制 - 在这种情况下，肠道微生物酵母组合物和/或功能分集对宿主进行生理学上有利的。

尽管我们目前还没有一种特定的生物标记物，可以作为膳食干预研究的独特结果，但对肠道微生物组成和/或功能特性的测量，以及其他免疫、生化和代谢参数，可能有助于提供宿主体内平衡能力的更清晰图景。因此,更好地理解有害和有益的肠道微生物社区的恢复力机制将实现新的治疗策略要被设计(例如，基因工程益生菌，以提高细菌的弹性和定植)这将维持肠道微生物生态系统的健康，反过来也会维持其人体宿主的健康．

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