6.TH.国会2016年11月9日至11日,国际人类微生物组联盟(International Human Microbiome Consortium)在德克萨斯州休斯顿举行了第一次IHMC大会。本次大会在美国举行,吸引了来自非洲、亚洲、拉丁美洲、澳大利亚、欧洲和美国的广泛国际观众。这个独特的科学家团体聚集在一起,讨论人类微生物学领域的广泛话题包括环境微生物与人体微生物群的相互干扰,肠道外微生物群落的重要性,母婴相互作用在微生物群早期建立中的作用,以及微生物群科学在全球健康中的重要性。在这篇文章中,我们强调了一些在会议上引起重要讨论的关键话题。

微生物组测序:16S或WGS -或两者都有?

在会议的第一天,一个重要的问题被提出给观众,并引发了激烈的辩论:随着微生物组学领域的发展,16S rRNA (16S)测序相对于全基因组散列(WGS)测序的相对效用是什么?当评估微生物群对疾病的影响时,我们应该依赖于相对粗糙的分类学和从16S数据推断的宏基因组调用吗?WGS测序阐明的深层功能数据是否需要在宿主-微生物生物学中发现有意义的见解?总的来说,更低的测序成本和更低的计算需求使16S测序成为大多数研究者的首选。然而,正如整个会议的众多演讲所证明的,仅16S数据可能会错过一个特定微生物群落的许多微妙之处。例如,博士Dusko埃利希是Metahit项目的主要贡献者和WGS测序的声音倡导者,证明了WGS测序允许他的小组识别患有特定细菌菌株的个体似乎对抗生素治疗有耐药性。此外,欧文博士证明了与体内相同的细菌物种的特定菌株差异局限于身体中的各个区域,表明对应变水平的给定利基的微生物适应。重要的是,这些发现几乎不可能发现使用16S数据,证明WGS测序在应变级别分析中的重要性。在整个会议中,大多数人都同意16S数据很有用,特别是评估微生物社区的快速和成本效益手段。然而,许多研究人员敏锐地希望WGS测序,但是当测序成本降低并且更先进的生物信息工具被广泛可用时,只会变得普遍。

我们的微生物群体来自哪里?

在致力于妇女和婴儿健康的会议中,玛丽亚Collado博士讨论了母亲的微生物群如何影响婴儿的微生物群发育。许多研究表明,胎儿的环境并不是无菌的,这表明妊娠期间的影响,如母亲的饮食可能在确定后代的微生物群中发挥关键作用。此外,母亲和婴儿微生物群之间的亲密接触并不会在出生时停止,例如,母乳含有许多生物活性成分-Such作为人乳寡糖(HMO)和牛奶微生物组 - 具有影响婴儿微生物组的潜力。具体而言,科拉多博士讨论了婴儿的母亲是谁是非人士(他们不携带积极的副本)FUT2基因,预防特定的HMOS的合成)具有推迟建立双歧杆菌属在他们的肠道里,这表明这些母亲母乳中HMO成分的改变影响了婴儿肠道微生物群的定植。鉴于早期微生物定植与婴儿免疫系统的成熟并行,在生命早期这一关键时期,扩大我们对母亲和环境对婴儿微生物群的影响的理解是一个需要进一步研究的重要领域。

是宿主驱动微生物群吗?

最后一组会谈试图确定改变我们的微生物群的因素,并剖析其对人类健康的潜在影响。值得注意的是,杰克·吉尔伯特博士芝加哥大学建议我们的皮肤不是我们微生物群的外部极限。他的作品表明,瞬态环境微生物可以对健康有巨大和持久的影响。他介绍了令人信服的数据关于Amish和Hutterite Homees的环境微生物,以及这些群体中哮喘的相对速率。Amish和Hutterites是类似的遗传血统,两种练习传统的公共生活方式。然而,它们在农业实践中有所不同:Amish仅使用人和动物力量,而赫格特则拥有工业养殖技术。阿米什儿童在来自年轻时的家庭农场工作,没有哮喘发病。然而,Hutterite儿童在家里外面的工作,直到生命后期,哮喘发病率近四倍。吉尔伯特博士发现,来自Amish和Hutterite谷仓的含微生物灰尘是保护肺炎的保护性,因此他在AMISH人口造型中的早期生命曝光造成了导致哮喘保护的先天免疫系统的发展。总体而言,这项工作突出了微生物群在驾驶稳态和促进健康方面的重要作用。通过获得对这些重要互动的洞察,在未来,我们可能能够通过利用微生物的力量来产生有针对性的疗法。