虽然肠道微生物组在成年期内仍然相对稳定,各种环境因素如疾病饮食据报道会影响肠道菌群组成。虽然寄主基因型可能影响微生物类群的相对丰度,发现宿主遗传学和肠道微生物群多样性之间的少数关联。因此,单个间肠道微生物组变异仍然在很大程度上是未解释的。

来自瑞士、法国、瑞典和美国不同机构的研究人员调查了858名来自法国的健康成年人,调查了各种社会人口学和环境因素在个体间肠道微生物群变异中的作用MilieuIntérieur.队列。他们通过16S核糖体RNA (rRNA)测序分析粪便样本,通过全基因组关联研究(GWAS)分析遗传变异,以及110种不同的非遗传因素,包括人口统计学、行为学、营养和医学数据。这些参与者生活在同一个地区,在整个研究期间,只有1%的人在服用非处方药物,以消除可能影响肠道微生物群的变量。

总的来说,所有非遗传因素解释了16.4%的变异,在分析的500多万个单核苷酸多态性(SNPs)中,没有发现关于粪便微生物多样性的显着基因组的侧面.另一方面,年龄与丙氨酸转氨酶水平有关(ALT),肾小球过滤速率,快餐餐厅吃早餐和吃饭是显着影响的变量α.- 大学模式,而性别和BMI没有显示任何一致的协会.此外,增加α.- 大学与通常被视为健康(水果,鱼类)的食物有关,同时减少与食品有关,通常被认为是不健康的油炸食品。

同意以前的研究,性和年龄对所有人产生了最大的影响β- 一位索引.其他因素有轻微但显著的相关性β- 这种队列中的大学包括病史(特别是水痘疫苗接种和牙齿提取),血液测量(ALT水平和舒张压),以及生活方式(如倾向于吃早餐或午餐以及胃口)。

最后,在探索某些因素如何在分类水平上影响肠道微生物,而Scepanovic和同事发现年龄与年龄之间的关联Comamonadaceae家庭和Schlegelella属。他们还发现口服矿物补充剂消费与papyrosolvens梭状芽胞杆菌物种,尽管这些发现的临床相关性目前未知。

总之,宿主遗传学似乎在塑造肠道微生物组中发挥着次要作用,同时各种非遗传因素,主要是人口统计和环境,与健康个体的单个分类群相关联。

虽然该研究在评估了几个宿主变量的评估中,但除了评估稀有遗传变异的更多样化的基因分型阵列之外,还需要对较大群组的纵向研究。此外,霰弹枪测序对于16S rRNA基因分型优选为整体肠道微生物组多样性和变异性的较窄的图像提供较窄的图像。希望在近期的偏见和基因组数据中可以汇集在群组中,以更广泛地了解宿主环境因素和遗传学如何塑造肠道微生物组。

参考:

Scepanovic P,Hodel F,Mondot S等人。健康个体肠道微生物群落多样性与人口统计学、环境和宿主遗传相关性的综合评估微生物胺,2019.doi: 10.1186 / s40168 - 019 - 0747 - x。