虽然整个成年期,肠道微生物群保持相对稳定,各种环境因素如疾病饮食据报道,据报道以影响肠道微生物群组成。虽然宿主基因型可能影响微生物类别的相对丰度在美国,宿主遗传和肠道微生物多样性之间的联系很少被发现。因此,个体间的肠道微生物群变异在很大程度上仍未得到解释。

来自瑞士,法国,瑞典和美国不同院校的研究人员调查了各种社会人口和环境因素在来自858名健康成年人的单个肠道微生物体变异中的作用。内环境队列。它们通过16S核糖体RNA(RRNA)测序,通过基因组 - 宽的关联研究(GWAs)以及包括人口统计,行为,营养和医疗数据的不同非遗传因素,以及包括人口统计学,行为,营养和医学数据的不同非遗传因素来进行粪便样本。这些参与者居住在同一个地区,并且在整个研究期间,只有1%的人在柜台药物上持续,以消除可能影响肠道微生物组的可能变量。

总之,所有非遗传因素都解释了16.4%的方差,分析了超过500万单核苷酸多态性(SNP),未发现与粪便微生物群落多样性相关的显著基因组广泛关联.另一方面,年龄以及丙氨酸氨基转移酶的水平血清谷丙转氨酶(ALT)、肾小球滤过率、吃早餐和在快餐店吃饭是显著影响所有指标的变量α-多样性模型,而性别和BMI没有显示任何一致的关联.而且,增加α多样性与通常被认为是健康的食物(水果、鱼)有关,而多样性的减少与通常被认为是不健康的食物(如油炸食品)有关。

与之前的研究一致,性别和年龄对所有因素的影响最大β多样性指数.其他因素有轻度但与之显着相关的因素β-该队列的多样性包括病史(特别是水痘疫苗接种和拔牙)、血液测量(ALT水平和舒张压)和生活方式(如倾向于吃早餐或午餐以及食欲)。

最后,在探索特定因素如何在分类水平上影响肠道微生物组时,斯帕诺维奇和同事发现了年龄和肠道微生物组之间的联系comamonadaceae.家庭和Schlegelella.属。他们还发现口服矿物质补充剂和纸酪蛋白胶囊vens尽管这些发现的临床意义目前尚不清楚。

综上所述,宿主遗传学似乎在塑造肠道微生物群中发挥了次要作用,而各种非遗传因素(主要是人口统计学和环境因素)与健康个体的个体类群有关。

尽管这项研究在评估几个宿主变量方面是全面的,除了评估罕见遗传变异的更多样化的基因分型阵列外,还需要更大队列的纵向研究。此外,霰弹枪测序优于16S rRNA基因分型,后者提供了整体肠道微生物群落多样性和变异性的更狭窄的图像。希望在不久的将来,宏基因组和基因组数据可以跨队列汇集,以获得对宿主环境因素和遗传学如何塑造肠道微生物组的更广泛的理解。

参考:

王志强,王志强,王志强,等。综合评估人口,环境和宿主基因协会,健康个体肠道微生物组多样性微生物,2019. DOI:10.1186 / s40168-019-0747-x。