发酵乳制品可以调节丁酸的产生种类

Patrick Veiga和MetaHIT的同事测试了发酵的奶制品是如何调节微生物群的。利用宏基因组学方法，他们发现，当患者服用发酵奶制品时，肠道中未知物种的数量增加了。在接触到功能性内容后，作者发现这些物种具有生产丁酸盐的功能性潜力。Patrick Veiga为我们提供了更多关于这项研究的见解。

你的背景是什么?
我有分子微生物学博士学位。达能纽特里西亚研究公司(Danone Nutricia Research)在2008年聘请我研究益生菌和肠道菌群之间的相互作用。这对我和达能来说是一个巨大的挑战，需要与学术伙伴(联手)。所以,我们所做的。

你的工作背景是什么?
在过去的十年中，我们见证了肠道微生物学的快速兴起，这是由于新技术的发展，允许深入和廉价的肠道微生物组测序。由INRA的Dusko Ehrlich博士领导的MetaHIT联盟在该领域发挥了关键作用，产生了革命性的生物信息学工具和概念(即。首个人类肠道微生物组、肠道类型和宏基因组物种的基因目录)发表在知名期刊上。
通过扩大我们对肠道菌群的了解，科学界开始意识到这个“被遗忘的器官”可能与一些西方国家相关的疾病有关(即。肥胖、糖尿病、炎症性肠病和肠易激综合症……)。

你工作中最具挑战性的部分是什么?
长期以来，我们假设某些活细菌(即。发酵乳制品中所含的益生菌也可能在结肠中活跃，并与我们体内的细菌相互作用。这一假设被测试了很多次，但许多小组都未能看到益生菌对肠道微生物群的影响。这可以简单地解释为缺乏高系统发育分辨率的现有工具。MetaHIT开发的工具达到了前所未有的分辨率，允许检测肠道菌群中单个物种的变化。这场革命还来自于这个新的生物信息学算法不仅可以量化已知的细菌，还可以量化未知的物种!不仅如此，这个工具还可以告诉你这些未知物种的功能!

4)主要发现和主要局限是什么?
我们成功地检测了人类肠道菌群的调节，在消费一种含有5种不同的细菌菌株的发酵牛奶产品，包括双歧杆菌lactis在肠易激综合征(IBS)受试者中。该产品调制的物种中有一半是未知的，如果不使用MetaHIT物种检测管道，就无法检测到。在这里，我们观察到一些被发酵乳制品刺激的未知物种可以产生丁酸盐，一种已知在肠道生理中发挥关键作用的有益分子。有趣的是，据报道丁酸盐在肠易激综合征中含量较低，这表明丁酸盐的增加可能对该人群有益。我们还观察到一种叫做Bilophila wadsworthia它被认为是西方饮食的最爱，会引发肠道炎症。

在这项研究之前，我们并不知道益生菌是如何调节人体肠道菌群的。今天，我们知道益生菌确实与宿主菌群相互作用，我们甚至对其背后的原因有一个假设，尽管这些假设需要未来的研究来验证。由于这项技术的发展如此之快，我们可以预期，在未来我们会发现由益生菌调节的新物种。我也相信，这些技术的发展将有助于我们更好地了解肠道生态系统的功能。

5)您的研究将如何帮助未来的临床医生?
在不远的将来，临床医生将能够以一种非常简单的方式绘制出患者的肠道微生物群，也许还能发现缺陷。通过了解益生菌可以提供哪些活动，他们将能够推荐一些益生菌来恢复失去的功能，并有利于栖居的有益微生物，如丁酸盐生产者。

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参考：Veigaet al。发酵乳制品引起的人体肠道微生物群的变化。科学报告．doi: 10.1038 / srep06328

INRA新闻稿：新技术揭示的含益生菌发酵乳制品对肠道菌群的影响．